Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copb2O55029 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Copb2O55029 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms