Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BckdkO55028 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BckdkO55028 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BckdkO55028 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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BckdkO55028 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdkO55028 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BckdkO55028 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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