Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms