Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms