Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms