Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffbO54788 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffbO54788 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DffbO54788 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DffbO54788 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffbO54788 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffbO54788 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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