Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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DffaO54786 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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DffaO54786 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DffaO54786 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DffaO54786 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DffaO54786 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms