Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms