Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd2O35927 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms