Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Foxd2O35392 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Foxd2O35392 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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