Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ColqO35348 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ColqO35348 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ColqO35348 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ColqO35348 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ColqO35348 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ColqO35348 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ColqO35348 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ColqO35348 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ColqO35348 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ColqO35348 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ColqO35348 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ColqO35348 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms