Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms