Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nedd9O35177 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nedd9O35177 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd9O35177 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms