Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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