Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ArxO35085 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ArxO35085 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms