Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms