Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5225J3QPL3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5225J3QPL3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms