Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms