Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms