Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm6594J3QM43 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms