Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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