Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubgcp6G5E8P0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms