Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna9G3X8Z7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms