Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim55G3X8Y1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms