Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Susd5G3UW60 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd5G3UW60 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms