Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms