Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms