Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox13F6YCR7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms