Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm42421F6X8D5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms