Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms