Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6619F6URP1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6619F6URP1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms