Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herc6F2Z461 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms