Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4E9QAP7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms