Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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