Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrdnE9Q9K5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms