Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf169E9Q7F2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf169E9Q7F2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf169E9Q7F2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms