Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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