Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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ApobE9Q414 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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ApobE9Q414 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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ApobE9Q414 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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ApobE9Q414 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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