Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r238E9Q373 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms