Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap46E9Q2C0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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