Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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