Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pdzd2E9Q1M1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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