Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930426L09RikE9Q0N7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930426L09RikE9Q0N7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms