Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gcom1E9PZ54 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms