Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Pkhd1E9PZ36 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms