Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms