Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931408C20RikE9PWP9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms