Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MccE9PWI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MccE9PWI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms