Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms