Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm9008E9PVG0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm9008E9PVG0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm9008E9PVG0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm9008E9PVG0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm9008E9PVG0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm9008E9PVG0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms